Studiował pod kierunkiem Folke Forsmana w Akademii Sibeliusa, którą ukończył w 1986 jako organista, a w 1987 uzyskał tytuł magistra muzyki kościelnej. W tym samym roku zadebiutował jako solista w helsińskiej katedrze. Swoje umiejętności doskonalił za granicą pod okiem znakomitych organistów, profesorów: Hansa Fagiusa (Sztokholm), Jona Laukvika (Stuttgart) i Jacques‘a van Oortmerssena (Amsterdam). Uczestniczył także w kilku kursach mistrzowskich. Dan Lönnqvist koncertuje nie tylko w krajach skandynawskich, ale także w Niemczech, Polsce, na Litwie, Łotwie, w Szwajcarii, Luksemburgu, Włoszech, Czechach i USA (Katedra Narodowa w Waszyngtonie). Wielokrotnie występował gościnnie podczas Letniego Festiwalu Organowego w Thüringen, gdzie również był członkiem jury konkursu organowego „Orgelland Thüringen”. Dan Lönnqvist wykłada muzykę organową w Novia University of Applied Sciences w Jakobstad w Finlandii. Jako długoletni prezes stowarzyszenia Calcanten organizuje wydarzenia muzyczne takie jak „Muzyka na Letnie Wieczory” i „Koncerty Organowe w Jokobstad”.